甲基转移酶复合体蛋白50 (MEP50) 是甲基转移酶复合体的一种组分，甲基转移酶复合体是一种蛋白精氨酸甲基转移酶复合体，可修饰某些剪切体 Sm 蛋白精氨酸和甘氨酸富集区域的特定精氨酸残基。MEP50 对于甲基转移酶复合体的活性非常重要，可调节 Sm 蛋白到运动神经元存活基因 (SMN) 复合体的转化，这也是 U snRNP 组装的前期步骤。甲基转移酶复合体和 SMN 复合体对剪切体 snRNP 的组装十分重要 (1)。
MEP50 是一种 WD 重复序列蛋白，可为甲基转移酶复合体蛋白之间多种蛋白相互作用提供一个界面。(1). 它可结合 JBP1，而 JBP1 是甲基转移酶复合体的一种精氨酸蛋白甲基转移酶组分。研究表明，MEP50 与 CTD 磷酸酶 FCP1 (CTDP1) 和 SUZ12 相互作用，CTDP1 是一种可能与转录伸长和剪切过程相关的蛋白 (2)，而 SUZ12 则是一种参与转录抑制的多梳家族蛋白 (3)。报道称，JBP1 和 MEP50 还与甲基 CpG 结合蛋白复合体 MBD2/NuRD 相互作用 (4)。